中國水產(chǎn)科學研究院長江所在鱘魚性別特異性分子標記開發(fā)方面取得新進展

　　中國水產(chǎn)科學研究院長江水產(chǎn)研究所魚類生殖發(fā)育與細胞工程研究團隊通過對施氏鱘雌雄群體進行基因組重測序以及比較分析，篩選到施氏鱘雌性性別特異性DNA片段，并通過引物設(shè)計和群體驗證，表明所獲得的雌性性別特異性DNA分子標記在鱘科魚類中具有通用性。相關(guān)研究成果近期在國際期刊《Genomics》（2021年影響因子為5.736）發(fā)表。

 

　　鱘魚個體大、初次性成熟時間長，但未成熟鱘魚雌雄個體之間沒有明顯的第二性征，早期從形態(tài)上無法辨別雌雄。此外，經(jīng)濟型鱘魚（施氏鱘、俄羅斯鱘和雜交鱘等）加工的魚子醬富含人體必需氨基酸、多種不飽和脂肪酸、維生素等物質(zhì)，營養(yǎng)價值極高，享有“黑色黃金”的美譽。因此，依照雌雄性別分別進行集約化養(yǎng)殖或一定性別比例進行飼養(yǎng)，可以減少飼養(yǎng)過多雄性個體造成的資源浪費，節(jié)約養(yǎng)殖成本。此前其他科研人員通過ISSR、AFLP、RAPD和RAD等不同分子標記技術(shù)檢測西伯利亞鱘、俄羅斯鱘、小體鱘、意大利鱘、湖鱘、波斯鱘和歐洲鰉、施氏鱘和中華鱘等鱘科魚類的雌雄個體基因組差異，都未能檢測到鱘魚的性別特異性DNA分子標記。

 

　　長江所魚類生殖發(fā)育與細胞工程研究團隊通過高通量測序技術(shù)，篩選雌雄特異性k-mers、含有特異性k-mer的reads進行序列組裝，并對組裝后的序列進行過濾、對獲得候選特異性片段設(shè)計引物進行群體驗證，最后獲得了雌性性別特異性DNA分子標記在施氏鱘、達氏鰉、中華鱘、達氏鱘、歐洲鰉、閃光鱘、俄羅斯鱘、西伯利亞鱘、小體鱘、大雜（達氏鰉♀×施氏鱘♂）和西雜（西伯利亞鱘♀×施氏鱘♂）等鱘科魚類中具有通用性。該研究結(jié)果不僅為監(jiān)測野生鱘魚種群性別比率及養(yǎng)殖鱘魚性別鑒定提供技術(shù)手段，而且也為鱘魚性別決定機制研究提供了基礎(chǔ)，將對提高鱘魚性別鑒定準確度，提早鱘魚性別鑒定年齡，助推鱘魚產(chǎn)業(yè)發(fā)展具有重要意義。

 

　　該研究得到了中國農(nóng)業(yè)科學院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所農(nóng)業(yè)基因組學技術(shù)研發(fā)與應用創(chuàng)新團隊的支持，同時獲國家重點研發(fā)計劃（2018YFD0900200）、國家自然基金（31702395）等項目的資助。該論文題目為“Screening and identification of female-specific DNA sequences in octaploid sturgeon using comparative genomics with high-throughput sequencing”，全文鏈接為https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0888754321003943。