近日，上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院生物技術(shù)實(shí)驗(yàn)室陳沁教授課題組采用大數(shù)據(jù)技術(shù)分析和預(yù)警食品安全事件取得新進(jìn)展，連續(xù)在在食品科學(xué)領(lǐng)域頂級期刊Food Control, International Journal of Food Microbiology和Transboundary and Emerging Diseases發(fā)表三篇研究論文。
成果1：研究通過轉(zhuǎn)錄組測序，生物信息學(xué)分析和基因編輯技術(shù)，找出影響克羅諾桿菌生物膜形成的關(guān)鍵基因malX，首次闡明了PTS對克羅諾桿菌生物被膜形成的調(diào)控機(jī)制，為進(jìn)一步防治克羅諾桿菌引起的食品污染奠定了基礎(chǔ)。上海大學(xué)陳沁教授和上海海關(guān)楊捷琳研究員為共同通訊作者，2020級研究生孔祥翔為第一作者。（International Journal of Food Microbiology, The maltose transporter subunit IICB of the phosphotransferase system: an important factor for biofilm formation of Cronobacter,https://doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2021.109517）
成果2：對中國市售豬肉中的重金屬污染情況進(jìn)行了綜合分析，使用單因素污染指數(shù)法，故障樹等風(fēng)險分析技術(shù)評估中國豬肉中重金屬（Pb、As、Cd、Hg）的污染水平，預(yù)測了致癌和非致癌風(fēng)險，同時找出最易有健康風(fēng)險的人群與對當(dāng)?shù)鼐用窠】滴：ψ畲蟮脑亍Ｔ撗芯繉⑸攀潮┞对u估與故障樹模型結(jié)合使用，在評估豬肉帶給居民的健康風(fēng)險的同時，找出了復(fù)雜豬肉消費(fèi)鏈中重金屬污染安全事件的根本原因，其研究結(jié)果可為中國豬肉產(chǎn)業(yè)鏈的監(jiān)管提供依據(jù)。陳沁教授和鈕冰副教授為共同通訊作者， 2019級研究生張慧為第一作者。（Food Control, Risk assessment of heavy metals contamination in pork, DOI:https://doi.org/10.1016/j.foodcont.2021.108793）
成果3：采用時空地理分析和最大熵等方法分析了2007年至2018年中國小反芻（PPR）疫情嚴(yán)空間分布和傳播特征，結(jié)合降水、溫度和海拔等氣象因素，使用機(jī)器學(xué)習(xí)方法建立預(yù)測模型。該研究對中國PPR的分析和預(yù)測將有助于提高對PPR預(yù)防和控制的認(rèn)識，有助于制定相關(guān)政策。陳沁教授為通訊作者，2018級研究生梁蕊蕊、2019級研究生張淑文和副教授鈕冰為并列第一作者。（Transboundary and Emerging Diseases, Spatiotemporal characteristics analysis and potential distribution prediction of peste des petits ruminants （PPR） in China from 2007–2018,DOI:https://doi.org/10.1111/tbed.14426）
以上研究工作得到了國家重點(diǎn)研發(fā)計劃、上海市科委項(xiàng)目的資助。
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