中國科學(xué)院計算機網(wǎng)絡(luò)信息中心等在解析小麥氮高效利用的分子機制研究中獲進展

　　土壤氮素短缺是限制作物生產(chǎn)的主要因子，從全基因組水平上解析作物氮高效的遺傳及分子機制，培育氮高效作物新品種，提高作物的氮素利用效率，是解決我國與世界農(nóng)業(yè)的面源污染、實現(xiàn)農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展和保護環(huán)境的關(guān)鍵。近日，中國科學(xué)院計算機網(wǎng)絡(luò)信息中心高性能計算部、中科院遺傳發(fā)育研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室與魯東大學(xué)合作，運用基因組測序與生物信息學(xué)手段，在解析小麥氮素高效利用的分子機制研究中取得重要進展。7月22日，相關(guān)研究成果以Comparative genomic and transcriptomic analyses uncover the molecular basis of high nitrogen use efficiency in the wheat cultivar Kenong 9204為題，在線發(fā)表在Molecular Plant上。

 

　　該研究圍繞氮高效小麥品種“科農(nóng)9204”的大尺度基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組及重要基因功能展開計算挖掘，高性能計算部研究團隊基于生物信息學(xué)與高性能計算技術(shù)，研發(fā)了大尺度基因組并行組裝與注釋的算法和軟件，組裝出“科農(nóng) 9204”的高質(zhì)量基因組序列，并系統(tǒng)地注釋分析了“科農(nóng)9204”的氮吸收和代謝相關(guān)基因。與氮低效品種“京411”對比，研究鑒定出小麥響應(yīng)缺氮的關(guān)鍵發(fā)育時期和相關(guān)的主要代謝途徑（圖1、2），為小麥氮高效的分子機制提供了新觀點，并為培育氮高效的小麥新品種提供了有價值的基因資源。

 

　　研究工作得到國家自然科學(xué)基金創(chuàng)新研究群體項目/重大研究計劃項目、中科院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專項、中科院“十三五”信息化專項課題的支持。