牛遺傳育種團(tuán)隊(duì)揭示牛成肌細(xì)胞染色質(zhì)可及性的動(dòng)態(tài)調(diào)控模式

　　近日，中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所牛遺傳育種科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)利用牛胎兒骨骼肌成肌分化體外模型，揭示了牛骨骼肌發(fā)育過(guò)程中的染色質(zhì)可及性和轉(zhuǎn)錄動(dòng)態(tài)調(diào)控模式。相關(guān)研究成果發(fā)表在《細(xì)胞增殖（Cell Proliferation）》（IF=6.831）上。

 

　　骨骼肌的生長(zhǎng)發(fā)育直接影響肉牛生長(zhǎng)速度和肉質(zhì)，胎兒期骨骼肌的發(fā)育對(duì)肉牛后天生長(zhǎng)發(fā)育有重要且長(zhǎng)期的影響。然而，當(dāng)前對(duì)于肉牛骨骼肌生長(zhǎng)發(fā)育這一重要性狀的基因組表觀調(diào)控機(jī)制仍不清楚。

 

　　研究人員利用牛胎兒骨骼肌分離、純化出成肌細(xì)胞并誘導(dǎo)分化，利用ATAC-seq和RNA-seq技術(shù)獲得了成肌細(xì)胞增殖分化全過(guò)程的染色質(zhì)可及性和基因表達(dá)信息。分析發(fā)現(xiàn)，牛成肌細(xì)胞體外增殖和分化過(guò)程中染色質(zhì)可及性和基因表達(dá)呈現(xiàn)動(dòng)態(tài)變化。研究還鑒定出階段特異性基因和染色質(zhì)可及性區(qū)域，揭示了參與牛成肌細(xì)胞增殖和分化的關(guān)鍵基因、轉(zhuǎn)錄因子及信號(hào)通路的時(shí)序性調(diào)控模式。整合轉(zhuǎn)錄組和GWAS結(jié)果，從基因組、表觀組及轉(zhuǎn)錄組多個(gè)層面探究了牛重要經(jīng)濟(jì)性狀基因組調(diào)控位點(diǎn)與基因組染色質(zhì)開(kāi)放區(qū)的關(guān)系。

 

　　該研究得到了中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院創(chuàng)新工程、國(guó)家肉牛牦牛產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系、國(guó)家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目的資助。李倩和王亞慧為論文共同第一作者，李俊雅研究員和張路培研究員為通訊作者。

 

　　原文鏈接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/cpr.13219