果樹所專家研究揭示非編碼RNA在蘋果不同組織中的表達特性

　　近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院果樹研究所蘋果資源與育種創(chuàng)新團隊蘋果資源課題組研究揭示非編碼RNA在蘋果根系、韌皮部、葉片、花和果實中的表達特性，揭示通過結(jié)合mdm-miR482可在蘋果不同組織中具抗逆作用的多個lncRNA和circRNA，發(fā)現(xiàn)circRNA: Chr00:18744403|18744580通過與mdm-miR16相互作用可參與花器官的形態(tài)建成和著色；lncRNA：MSTRG.60895.2可作為mdm-miR393的模擬靶標(biāo)調(diào)控MD17G1009000的表達，它可能在蘋果果實的花青素代謝中具重要作用。相關(guān)成果發(fā)表在《基因（Genes）》和《國際分子科學(xué)（International Journal of Molecular Sciences）》上。

 

　　非編碼RNA作為近年來的研究熱點，可直接調(diào)控mRNA的表達，亦可通過結(jié)合miRNA進而調(diào)控mRNA的表達，在植物的形態(tài)建成、生物和非生物逆境中具重要的調(diào)控作用。

 

　　該研究從蘋果5個主要組織中鑒定得到6495個circRNA和9440個lncRNA，獲得不同組織中特異表達的lncRNA和circRNA，通過功能預(yù)測，miRNA靶位點預(yù)測等手段，獲得特異表達lncRNA和circRNA在組織的特異表達特性和功能，以上結(jié)果為非編碼RNA在蘋果不同組織的功能解析奠定了基礎(chǔ)。

 

　　原文標(biāo)題：expression Characteristics in Roots, Phloem, Leaves, Flowers and Fruits of Apple circRNA