山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所在洋蔥高密度遺傳圖譜構(gòu)建及花薹高度相關(guān)SNP鑒定方面取得重要進(jìn)展

　　近日，山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所鱗莖類蔬菜育種與栽培創(chuàng)新團(tuán)隊洋蔥課題組在Frontiers in Plant Science（IF=6.627；JCR1區(qū)，中科院2區(qū)）發(fā)表了題為“Construction of a high-resolution genetic map and identification of single nucleotide polymorphism markers relevant to flower stalk height in onion”的研究論文。

 

　　洋蔥（Allium cepa L.）具有重要的園藝和藥用價值，其分布廣泛，南北各地均有栽培，是國內(nèi)主栽蔬菜之一，也是出口創(chuàng)匯的主要蔬菜之一。由于洋蔥為二年生植物且其基因組龐大、重復(fù)序列較多、遺傳背景狹窄等原因，洋蔥高密度遺傳圖譜的構(gòu)建和基于圖譜的基因挖掘工作一直落后于番茄等其他蔬菜作物。

 

　　本研究利用洋蔥兩個雙單倍體（DH-1×DH-17）為親本構(gòu)建的F2群體為研究材料，采用SLAF-seq技術(shù)構(gòu)建了洋蔥高密度遺傳圖譜。該遺傳圖譜全長928.32 cM，平均圖距0.09 cM，包含8個連鎖群，10,584個多態(tài)SLAFs、21,250個SNP標(biāo)記。利用該圖譜，首先對調(diào)控雄性可育性狀（Ms）的位點進(jìn)行了QTL定位，定位結(jié)果與前人一致，說明該遺傳圖譜具有較高的質(zhì)量。其次檢測到49個與花薹高度相關(guān)的SLAF標(biāo)記，其中20個SLAFs被認(rèn)為是花薹高度性狀雜種優(yōu)勢的有效有利等位變異標(biāo)記，可用于后期花薹高度相關(guān)基因或KASP標(biāo)記的開發(fā)。本研究中構(gòu)建的高質(zhì)量高密度洋蔥連鎖圖譜為洋蔥花薹高度等重要農(nóng)藝性狀的精細(xì)定位和候選基因鑒定奠定了基礎(chǔ)，也為洋蔥育種發(fā)育遺傳機(jī)制的研究提供了新思路。

 

　　蔬菜研究所李艷偉博士為該論文第一作者，吳雄研究員和劉冰江研究員為該論文的共同通訊作者。該研究得到了國家蔬菜產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系和山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新工程的資助。原文鏈接：https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2023.1100691/full（撰稿：李艷偉，核稿：王鳳德）