關(guān)于舉辦“蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)解析與智能設(shè)計專題 （線上）培訓(xùn)班”的通知

 

　　蛋白質(zhì)通常被稱為生命的基石，它們幾乎參與了細胞內(nèi)的每一個過程，包括生長、分裂和修復(fù)。蛋白質(zhì)是生命活動的體現(xiàn)者，其結(jié)構(gòu)決定著功能。由線性氨基酸組成的蛋白質(zhì)需要折疊成特定的空間結(jié)構(gòu)才具有相應(yīng)的生理活性和生物學(xué)功能。解析蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)可以更準確地認識蛋白質(zhì)的功能、功能的執(zhí)行、及生物大分子間的相互作用。然而，隨著人工智能及大數(shù)據(jù)的快速發(fā)展，蛋白質(zhì)可以通過人工智能設(shè)計從而解鎖更多的功能，這在食品學(xué)、醫(yī)學(xué)和藥學(xué)的發(fā)展(如多肽、酶、藥物靶點的設(shè)計等）具有重要意義。因此，為了進一步挖掘蛋白質(zhì)新功能與充分發(fā)揮人工智能在醫(yī)藥及生物領(lǐng)域的快速發(fā)展，協(xié)會決定于2024年1月13-14日在線上（小鵝通平臺）舉辦“蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)解析與智能設(shè)計專題培訓(xùn)班。”屆時將邀請行業(yè)內(nèi)知名專家針對相關(guān)內(nèi)容進行講解與探討。參會名額有限，望各有關(guān)單位積極轉(zhuǎn)發(fā)或組織相關(guān)人員盡快報名參加。現(xiàn)將有關(guān)事項通知如下：

 

　　一、會議安排：

 

　　直播平臺：小鵝通在線直播平臺

 

　　1月12日：下午15：00-15：30平臺網(wǎng)絡(luò)及設(shè)備測試

 

　　1月13日-14日：上午9：00-12：00，下午14：00-17：00培訓(xùn)課程

 

　　（詳情參考附件一）

 

　　二、培訓(xùn)形式

 

　　1、理論講解，實例分析，專題講授，互動答疑

 

　　2、完成全部培訓(xùn)課程者由協(xié)會頒發(fā)培訓(xùn)證書

 

　　三、組織機構(gòu)

 

　　主辦單位：中國化工企業(yè)管理協(xié)會醫(yī)藥化工專業(yè)委員會

 

　　承辦單位：中科凱晟化工技術(shù)研究院

 

　　四、培訓(xùn)課程及專家情況（詳情參考附件一）

 

　　五、培訓(xùn)對象

 

　　1.蛋白質(zhì)工程領(lǐng)域科研單位專家及學(xué)者；

 

　　2.醫(yī)學(xué)、藥學(xué)及食品學(xué)院校及企業(yè)蛋白質(zhì)功能開發(fā)負責(zé)人；

 

　　3.生物工程領(lǐng)域從業(yè)工作者。

 

　　六、會議費用

 

　　4000元/單位，可投屏全員觀看（含5個直播鏈接、2本資料、1個月有效期回放）

 

　　七、問題及報告征集（截止到1月9日）：

 

　　請在回執(zhí)表問題征集欄填寫您所關(guān)注及遇到的問題，以便講師在備課時更具備針對性。

 

　　八、聯(lián)系方式：

 

　　電    話：18153592317（微信同號）  
 

　　聯(lián) 系 人：胡老師              
 

　　附件一：會議課程安排表

 

　　中國化工企業(yè)管理協(xié)會醫(yī)藥化工專業(yè)委員會

 

　　中科凱晟化工技術(shù)研究院

 

　　二○二三年十一月

 

　　附件一：

 

　　1月12日下午15：00-15：30線上測試

 

　?。ǖ谝惶欤?月13日

 

　　上午  09：00 - 12：00       下午  14：00 - 17：00《蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測與解析》 1.蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測 蛋白質(zhì)理化性質(zhì)和一級結(jié)構(gòu)分析 分析蛋白質(zhì)的 pI、Mw、氨基酸組成、消光系數(shù)、穩(wěn)定系數(shù)等 分析蛋白質(zhì)的親水性和疏水性 分析蛋白質(zhì)的跨膜區(qū) 信號肽預(yù)測 SignalP 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域預(yù)測 2.蛋白質(zhì)表達純化 從基因克隆到蛋白表達 不同表達體系的質(zhì)粒構(gòu)建及優(yōu)化 蛋白及復(fù)合物的表達及優(yōu)化策略 蛋白質(zhì)純化及表征 蛋白質(zhì)的純化方案 蛋白復(fù)合物的制備和純化 天然蛋白的制備和純化 蛋白質(zhì)的鑒定和理化性質(zhì)分析 高難度蛋白質(zhì)樣品制備的思路和方法 3.蛋白質(zhì)結(jié)晶條件篩選和優(yōu)化 蛋白晶體結(jié)構(gòu)的特征 晶體的晶胞、晶系、空間群 蛋白晶體生長的理論知識 蛋白晶體生長條件初篩 蛋白晶體生長條件優(yōu)化 4.晶體衍射數(shù)據(jù)收集與處理(XDS, HKL, Aimless)  X射線衍射 X射線衍射的原理 X射線衍射的電子密度 晶體結(jié)構(gòu)解析的相角問題 上海光源線站BL18U1、BL19U1和BL02U1收集數(shù)據(jù)的方法 5.相位解析和優(yōu)化(phenix,CCP4) 蛋白晶體結(jié)構(gòu)解析軟件的安裝（包括Ubuntu系統(tǒng)、Phenix軟件、CCP4軟件、 PyMoL軟件、XDS軟件和Adxv軟件） 晶體結(jié)構(gòu)解析流程 Index、Intergrate和Scale 分子置換技術(shù)  蛋白晶體結(jié)構(gòu)的重建 蛋白晶體結(jié)構(gòu)的優(yōu)化 晶體結(jié)構(gòu)質(zhì)量的評價指標 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)中加入小分子配體 在結(jié)構(gòu)解析過程中，如何利用軟件提高分辨率 6.PDB數(shù)據(jù)提交  傅老師，畢業(yè)于美國東北大學(xué)。曾就職于默克集團，上海維亞生物公司。現(xiàn)于青云瑞晶負責(zé)x-ray晶體學(xué)結(jié)構(gòu)解析工作，有豐富的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)解析經(jīng)驗。 陳老師，博士，蘇州青云瑞晶生物科技有限公司，結(jié)構(gòu)生物學(xué)負責(zé)人。畢業(yè)于中國科學(xué)院生物物理研究所結(jié)構(gòu)生物學(xué)專業(yè)，師從葉克窮教授從事RNA蛋白質(zhì)復(fù)合物的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究。從2009年開始蛋白質(zhì)RNA復(fù)合物的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究，有10年以上的蛋白質(zhì)表達純化及結(jié)構(gòu)解析經(jīng)驗。在Elife、Nature Communication、Angewandte、Nucleic Acids Research等雜志發(fā)表多篇文章。在北京大學(xué)深圳研究生院、北京 生命科學(xué)研究所和北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院均進行過研究工作。在北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院博士后工作期間，解析了重要疾病靶點和小分子的結(jié)構(gòu)，積累了豐富經(jīng)驗。

 

　?。ǖ诙欤?月14日

 

　　上午  09：00 - 12：00《蛋白質(zhì)工程與定向進化》(溝通中...） 1.定向分子進化的概念和原理 2.突變庫構(gòu)建 3.高通量篩選 4.連續(xù)進化 5.應(yīng)用場景 陳老師，博士，教授。2007年畢業(yè)于中國科學(xué)技術(shù)大學(xué) 生物化學(xué)與分子生物學(xué)系，獲理學(xué)博士學(xué)位。2007至2009年赴美國梅奧醫(yī)學(xué)院(Mayo Clinic)從事博士后工作，研究G蛋白偶聯(lián)受體的結(jié)構(gòu)和功能。2009至2011年赴南加州大學(xué)從事鋅指蛋白的設(shè)計與篩選相關(guān)研究。2011年3月作為中國科技大學(xué)優(yōu)秀人才引進，現(xiàn)任生命科學(xué)學(xué)院副教授。2009年獲17多肽調(diào)控國際會議優(yōu)秀博士后獎。主要研究成果發(fā)表于Journal of Biological Chemistry, Am. J. Physiol. Endocrinol. metab, Protein Science等相關(guān)領(lǐng)域國際重要期刊。

 

　　下午  14：00 - 17：00《蛋白質(zhì)序列和結(jié)構(gòu)升級》 1.蛋白質(zhì)化學(xué)組成與穩(wěn)定蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的分子相互作用 2 分子力場、統(tǒng)計能量與人工智能簡介 3 基于能量函數(shù)的蛋白質(zhì)設(shè)計技術(shù) 4.基于深度學(xué)習(xí)的蛋白質(zhì)設(shè)計技術(shù) 5.功能蛋白質(zhì)設(shè)計展望 劉老師，男，中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)講席教授。國家基金委杰出青年基金獲得者、創(chuàng)新群體項目負責(zé)人。1985-1996年在中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)生物系學(xué)習(xí)并先后獲學(xué)士和博士學(xué)位。曾在蘇黎世高等理工學(xué)院研究生聯(lián)合培養(yǎng)以及在Duke大學(xué)和UNC Chapel Hill從事博士后研究等。2001年起任中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授。主要研究方向為蛋白質(zhì)設(shè)計和基于計算的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)功能研究。在包括Nature及子刊、PNAS、JACS、PRL等雜志發(fā)表論文百余篇。