中國水產(chǎn)科學(xué)研究院淡水中心在解析錦鯉和福瑞鯉色素沉積分化研究上取得新進展

　　近日，淡水漁業(yè)研究中心水產(chǎn)遺傳育種研究室董在杰研究員團隊通過全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）解析了不同鯉品系的遺傳結(jié)構(gòu)，挖掘了體色調(diào)控關(guān)鍵基因，在錦鯉和福瑞鯉色素沉積分化研究上取得新進展。

 

　　魚類體色分化和變異是生物進化和系統(tǒng)發(fā)育研究的重要組成部分，受遺傳、營養(yǎng)、生理激素和飼養(yǎng)環(huán)境等多種因素影響，其中遺傳影響最為關(guān)鍵。通過提高對不同鯉群體遺傳信息的理解，有助于后續(xù)深入開展色素細胞關(guān)鍵調(diào)控基因編輯應(yīng)用及精準(zhǔn)育種路線的設(shè)計。研究研究團隊基于簡化基因組手段（2d-RAD）解析了6個錦鯉品種（紅白、大正、昭和、古黃金、松川化和五色）與福瑞鯉2號（青灰色、紅色）的相關(guān)遺傳信息。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，與福瑞鯉2號相比，錦鯉的遺傳多樣性相對較低；且福瑞鯉2號和錦鯉之間存在明顯的種群分化。GWAS分析挖掘到與體色差異顯著相關(guān)的18個SNP位點，以及影響黑色素合成（ephrinb2、slc22a23、herc2和ephb2等）、類胡蘿卜素代謝（oca2、bcmo1和bco2等）和晝夜節(jié)律相關(guān)基因（cipc）的突變。

 

　　本研究工作得到了江蘇省農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新資金〔CX（21）2029〕、國家自然科學(xué)基金（32202924）、水科院淡水漁業(yè)研究中心基本科研業(yè)務(wù)費（2024JBFR02）和江蘇省自然科學(xué)基金（BK20220227）項目的支持。相關(guān)成果論文“Genome-wide association study reveals candidate genes critical for skin pigmentation in common carp （Cyprinus carpio） strains including koi”發(fā)表在中科院一區(qū)期刊《Aquaculture》上。漁業(yè)學(xué)院博士研究生史秀蘭為第一作者，水產(chǎn)遺傳育種研究室羅明坤博士和董在杰研究員為通訊作者。

 

　　論文全文地址：10.1016/j.aquaculture.2024.741075