北京畜牧獸醫(yī)研究所畜禽種質(zhì)資源保護與利用團隊揭示中國、巴基斯坦和尼泊爾家山羊群體遺傳關(guān)系

　　中國農(nóng)業(yè)科學院北京畜牧獸醫(yī)研究所畜禽種質(zhì)資源保護與利用科技創(chuàng)新團隊研究揭示了中國、巴基斯坦和尼泊爾山羊群體的遺傳關(guān)系，篩選出調(diào)控山羊熱適應(yīng)性、產(chǎn)絨和產(chǎn)奶的關(guān)鍵候選基因與SNP錯義突變位點，為進一步研究山羊適應(yīng)性及表型性狀的遺傳機制、促進地方品種分子育種提供理論基礎(chǔ)。相關(guān)成果發(fā)表在《遺傳學報（Journal of Genetics and Genomics）》。

 

　　家山羊作為最早馴化的家畜之一，廣泛分布于世界各地，形成了許多適應(yīng)性強、表型特異的地方品種。中國、巴基斯坦和尼泊爾地區(qū)擁有豐富多樣的地方山羊品種，然而各地區(qū)品種間群體結(jié)構(gòu)、基因交流及表型差異的遺傳機制尚不清楚。

 

　　研究人員收集分析了中國、巴基斯坦和尼泊爾的15個代表性家山羊品種共115個樣本以及4個野山羊樣本的全基因組數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)家山羊群體結(jié)構(gòu)可分為巴基斯坦羊、尼泊爾羊、中國藏山羊、中國北方絨山羊、中國南方山羊和奶山羊六類。進一步通過基因流分析發(fā)現(xiàn)，尼泊爾平原羊和中國湘東黑山羊、尼泊爾高原羊和中國藏山羊間遺傳交流較為密切。此外，選擇信號分析篩選出與山羊熱適應(yīng)和產(chǎn)絨性狀相關(guān)的基因，并且在家山羊18號染色體上發(fā)現(xiàn)一個與產(chǎn)奶性狀密切相關(guān)的候選基因ACSF3，其基因型在產(chǎn)奶山羊群體和非產(chǎn)奶山羊群體間顯著分離。利用三維結(jié)構(gòu)模型預測出該基因錯義突變可能影響蛋白結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性，對山羊產(chǎn)奶性能具有潛在的負調(diào)控作用。

 

　　博士生李業(yè)芳為該論文第一作者，馬月輝研究員和蔣琳研究員為共同通訊作者。該研究得到國家自然科學基金、國家絨毛用羊產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系等項目資助。

 

　　原文鏈接：https://doi.org/10.1016/j.jgg.2023.01.010